吃石榴不吐籽,軟籽石榴做得到!然而,與硬籽石榴相比,國內廣泛栽培的軟籽石榴“突尼斯”不抗凍的特點嚴重威脅和限制了產業健康發展。近日,Plant Biotechnology Journal在線發表了中國農業科學院鄭州果樹研究所研究員曹尚銀課題組完成的軟籽石榴“突尼斯”的高質量基因組圖譜,為解析軟籽和硬籽石榴品種分化遺傳機制提供了支撐,并為軟籽石榴遺傳改良研究奠定了重要基礎。


科學家破譯軟籽石榴“突尼斯”基因組密碼 將來?吃石榴可以不吐籽


石榴(Punica granatum L.)是一古老的落葉灌木果樹樹種,栽培歷史悠久。論文通訊作者曹尚銀告訴《中國科學報》,石榴被譽為“生命之果”,其果皮、果肉以及種子均含有豐富的類黃酮、多酚、花青素等抗氧化物質,有利于預防高血脂、高血壓、HIV、傳染性疾病、冠心病、前列腺癌癥等疾病。尤其是軟籽石榴品種,籽粒硬度小,食用時易于吞咽,避免了營養的流失;此外,軟籽石榴市場售價通常是普通品種的2——4倍,是廣大果農脫貧致富的良果佳品。


論文第一作者駱翔博士介紹,該研究基于二代和三代測序獲得了軟籽石榴“突尼斯”高質量基因組序列,基因組大小為320.31 Mb,Contig N50為4.49 Mb,注釋了33,594個基因。采用Hi-C光學技術結合遺傳圖譜將97.76%的序列組裝到了8對染色體上。與現有的“泰山紅”石榴基因組相比,“突尼斯”多組裝出了46.01Mb序列,Contig N50的平均長度提升了46倍,在組裝完整度及精確度上都得到了極大地提升。


科學家破譯軟籽石榴“突尼斯”基因組密碼 將來?吃石榴可以不吐籽


比較基因組學研究表明,軟籽“突尼斯”基因組和硬籽“泰山紅”“大笨籽”基因組間存在著大量的SNP和InDel變異。對26個石榴品種進行群體遺傳學分析表明,軟籽石榴群體和硬籽石榴群體間存在著大量的受選擇位點。尤其是Chr1上,存在著高達26.2Mb的受選擇區段。基因注釋信息表明,與基因組變異及選擇信號相關的基因潛在地影響著石榴硬籽和軟籽特性分化。


本研究得到了中國農業科學院科技創新工程以及國家科技基礎性工作專項重點項目的資助。


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關于突尼斯軟籽石榴


突尼斯軟籽石榴于1986年從突尼斯引入我國, 歷經10多年的栽培試驗和觀察,各方面性狀表現優異,尤以成熟早(8月中旬、農歷7月初籽粒開始著色變紅)、籽粒大(百粒重56.2克)、色澤鮮(籽粒紅色)、果個大、果紅色美觀、果仁特軟等特點突出,經濟效益十分顯著。

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